“O Doxygen é um sistema de documentação para C, C++, Java, C#, Python e outras linguagens. Com ele é possível gerar documentação em HTML, RTF, PostScript, PDF e até man pages.”

Essa dica veio através do meu amigo Felipe Farias, que me enviou o link do site do Daniel, que contém um excelente tutorial para quem precisa gerar documentação do seu código de uma maneira fácil e eficiente.
Com apenas poucos comandos, é possível ter uma página web com toda a documentação do seu código, e a maneira de documentar o código para o doxygen é muito parecida com a utilizada pelo JAVADOC.
Fica ai mais uma dica, que vale a pena conferir.
Fonte: Daniel Matte Freitas