Alex Willmer, um administrador de banco de dados inglês, postou em seu blog um artigo explorando a necessidade e os candidatos a serem os sucessores do shapefile como o “padrão de fato para dados geoespaciais.

Ele sugere como opções os seguintes formatos: File Geodatabase, Spatial Data Format e Spatialite. Para saber mais detalhes confira o artigo na integra.
Fonte: Misspelled nemesis club